《超级机器人大战α》这款游戏是一款角色扮演类的动作冒险游戏，在游戏中玩家们将在游戏中体验驾驶新的机甲加入到全新的战役中去。
本作剧情主线不再围绕DC战争了，而是自新机战起加入的原创系作品《超机大战SRX》所贯穿的主线“巴尔玛帝国战役”，加入了许多新的机体和作品。地图与之前在《魔装机神》中曾经运用过的45度角立体地图一样，能令玩家非常真切地感觉到地形的高低差。
本作的一大亮点是首次加入了熟练度这一新的设定，熟练度的高低将会影响许多方面，诸如玩家能否得到隐藏机体、隐藏武器、每话出现的敌人多寡难度以及金钱的多少等等；并新增机体换装指令；另一小改进是当机师的击坠数超过50机成为“王牌机师”后，每次登场气力初始值为105，这是一个很好的设计。
布鲁克林·拉克菲尔德（ブルックリン・ラックフィールド，声优：杉田智和）
认真且富正义感。爱称是是布里德（ブリット）。战后加入DC，担当人型机动兵器的测试驾驶员。精通剑道、有时会对日本文化产生误会的设定在OG系列也存在。《第2次α》《第3次α》的楠叶编亦以以楠叶的搭档身份参战。
水羽楠叶（クスハ・ミズハ，声优：高桥美佳子）
内向且优柔。战后决定成为医生并开始相关的学习。
喜欢长时间洗澡。本作没有制作营养饮品（楠叶汁）的兴趣。OG系列是隆圣的青梅竹马，α系列则没有这设定。不过在《第3次α》的特别剧情中有关于此设定的对话。《第2次α》《第3次α》的楠叶以超级系主人公身份登场，并继承了决定成为医生的设定。另外本作中楠叶的初期设定是真实系。
蕾欧娜·加修坦因（レオナ・ガーシュタイン，声优：雏野まよ（现・榊原由依））
沉着冷静且头脑清晰。战后听从ロイ・フォッカー和ブルーノ・J・グローバル的建议加入了SDF。
不会料理而且是音痴。和SRX小队的莱是表兄妹关系，不过在本作没有提及。除了音痴的设定外，其他设定在OG系列都继续存在（音痴的设定方面，制作人寺田贵信在スパロボOGネットラジオ うますぎWAVE曾提及“曾经为了是否使用这个设定而迷惑过”。担当声优榊原由依曾提及“自己选拔时的音声在游戏本编中也有被使用”。
真宫寺·祐（タスク・シングウジ，声优：山口胜平）
乐观且活力充沛。战后跟破岚万丈一起致力于战后复兴。
喜欢测试自己的运气。手工很灵巧。好女色，虽然反应很快但其实是运动白痴的设定在OG系列也存在。
游戏开始时要先进行主人公的设定。虽然声优只能根据性格转变，但名字与外貌则可以任意变更，而根据生日则可以习得不同的精神指令。超级系的机体是古伦加斯特弐式和龙虎王。真实系则为凶鸟Mk-II和凶鸟Mk-III。
主人公和恋人的背景设定方面，超级系是跟兜甲儿一样为东城学园的高校生，真实系则为毛氏工社的社员。两者皆于序盘突然被卷入战斗，然后恋人失踪。之后主人公成为隆巴纳队的一员，而恋人则失去了记忆并被伊鲁姆保护。虽然伊鲁姆与恋人曾因为个人目的而与隆巴纳队战斗，但最终也会加入我方。顺带一提，不论主人公是超级系还是真实系，恋人的能力都是偏向超级系的。
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