《新约：东方幻想杀》将延续前作《东方幻想杀》的设定，游戏中你将操作东方PROJECT与魔法禁书目录的主要角色组成的临时组合进行冒险。
作弊组：灵梦＋当麻：灵梦是照抄辉针城梦Ｂ，一如既往的小判定平衡型，而当麻的技能是低速时可以消掉身边部份弹幕，这是一个可以把难度足足降低两档的机体，Ｌ变Ｎ，Ｎ变⑨。
魔炮组：魔理沙＋炮姐：没有那张作弊符卡的辉针城魔Ｂ，炮姐高速是扩散型，低速是较宽的贯通型，直来直往，这一组是难度最高的，因為没有作弊技，火力也其实不如时空组。
时空组：咲夜＋白井黑子：辉针城夜Ｂ加上道具掉较慢的特殊技，没什麼可观，而低速黑子是本作火力最强的，击中敌人后还会再从板底產生直线贯穿弹再打一次，甚至可以在一些非符或符卡出大招（如ＥＸ道中ＢＯＳＳ非符）前完封。
三组自机都打通正篇以后，会解锁第四组奇迹组。
奇迹组：早苗是星莲船苗Ｂ，搭档是苗Ａ加上低速射击时春度（ＳＰ）收集快的特技，这一点让这组人成為比作弊组更好混关的机体。
《新约.东方幻想杀》的画风和东方正作一样，游戏的系统比较复杂，妖妖梦Ｘ神灵庙的森罗结界，辉针城的奖励机制，还有永夜抄Ｘ地灵殿的角色转换，非常有趣。
东方的剧情主要是发生在一个相对于我们这个世界（现实世界），独立却又相互联系的异世界之中的，它的名字叫「幻想乡」。幻想乡被结界所包围，构成了一个独特的生态系统。与现实世界不同的是，幻想乡其中除了人类，还生活着许多妖怪、神明等非人类的存在。不论是身怀异能 ...
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